O tratamento da trombose de veia porta varia de acordo com o tempo de início do quadro (agudo ou crônico), apresentação clínica, fatores etiológicos associados e idade dos pacientes. Os objetivos do tratamento devem ser::
- reverter ou prevenir progressão da trombose do sistema porta e
- tratar as complicações já presentes, principalmente as varizes esofagogástricas e alterações biliares.
Resolução espontânea acontece em poucos casos e em frequência mais baixa do que a observada nos pacientes que recebem tratamento.